新医改争议最多的地方，发生在基本药物制度上。无他，只因为基本药物制度，改变的是药物生产、流通、定价等的整个产业链条，调整的是一大批有组织的经济体的利益。争议主要发生在两大部门之间——卫生部跟人力资源和社会保障部。
新医疗方案涉及到千家万户的切身利益，尤其是基本药物制度更是新医改方案的核心内容。现在，卫生部跟人力资源和社会保障部围绕这项医疗变革重头戏，展开激烈对决和争辩，无疑能促进公共政策的最优化。
然而，细心的人不难发现，两部委就医改方案的基本药物制度，进行猛烈交锋，并非是为了公共利益，而是为了各自的部门利益，展开殊死搏斗式的博弈。正如业内人士分析那样，人保部之所以对《基本药物目录》心存芥蒂，就在于他们醒悟过来：谁掌握了基本药物目录，谁就主导了基本药物采购、生产、供应等的整个链条。
无利不起早。就卫生部跟人力资源和社会保障部二者之间的利益之争，就可预知医疗改革的艰难程度。基于部门利益的掣肘，以及我国现行基本药物制度的弊端，笔者觉得，国家很有必要把《基本药物目录》和《医疗保险目录》合二为一，形成新的《国家基本药物目录》。
首先，能够实现步调一致，齐唱“同一首歌”。眼下，《医疗保险药物目录》由人力资源和社会保障部制定，《基本药物目录》则由国家食品药品监督管理局制定。这两个目录中有80%的药品品种是重叠的，一些药物在基本药物目录中有，医保目录中没有，还有一些药物医保目录中有，基本药物目录中没有，加在一起是20%左右。倘若两目录能够合并，就会有效避免在目录制定上“各吹各的号，各唱各的调”，实现步履一致，共唱“一首歌”。
其次，体现社会医疗公平，提高社会保障效率。现行的两种基本医疗药品目录，即用于公费医疗的基本药品目录和用于医保的基本医保药品目录。既然在同一个国度，无论是属于公务员序列的公费医疗，还是属于一般阶层社会人员的医保医疗，在用药目录上不应有任何区别，更不能再分出三六九等来；与此同时，两者的割裂，也给医保和财务人员带来很多麻烦，严重影响到工作效率。如果两者实现“联姻”，变成“一家”，不仅能充分体现社会医疗的公平公正，还会大大提高医疗报销效率。
最后，也会大大节约社会成本。随着我国医疗保障事业发展，《基本药物目录》和《医疗保险目录》也要紧跟时代步伐，不断进行修订，制定新版本。假设二者合二为一后，国家基本药品目录的更新和修订工作，就会一改过去那样，两套人马齐上阵，很明显，会节约大量的社会人力、物力和财力。
当然，合二为一的新《国家基本药物目录》不能像现行的目录那样臃肿肥胖，要大力推行“瘦身”运动。因为，在药物数量上，世界卫生组织推荐的基本药物目录仅有312种药品，日本的基本药物是200多种，泰国是80多种。而我国现有基本药物目录是2004年版本，收录的基本药物品种高达2000余种，其中，西药品种近800个，中药品种1000多个，远远高于世卫组织和其他国家核定的品种数量。因此，合二为一的新《国家基本药物目录》实现精兵减政也应成为今后修订的主攻方向。
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